Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTP0

Shcbp1l, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1lQ3TTP0 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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