Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIU4

Pde12, 2',5'-phosphodiesterase 12, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde12Q3TIU4 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms