Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Hddc2Q3SXD3 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hddc2Q3SXD3 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms