Protein–RNA interactions for Protein: Q3LR78

Zbtb38, CtBP-interacting BTB zinc finger protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb38Q3LR78 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Cd59a-201ENSMUST00000040423 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 4930589L23Rik-201ENSMUST00000091023 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Gm16833-202ENSMUST00000189204 672 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Gm42651-201ENSMUST00000199851 1339 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Vmn1r34-201ENSMUST00000074381 930 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zbtb38Q3LR78 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms