Protein–RNA interactions for Protein: Q30D77

Col24a1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, mousemouse

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Length 1,733 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col24a1Q30D77 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col24a1Q30D77 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Col24a1Q30D77 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Col24a1Q30D77 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col24a1Q30D77 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col24a1Q30D77 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Col24a1Q30D77 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Col24a1Q30D77 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Col24a1Q30D77 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col24a1Q30D77 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col24a1Q30D77 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col24a1Q30D77 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col24a1Q30D77 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
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Col24a1Q30D77 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col24a1Q30D77 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col24a1Q30D77 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col24a1Q30D77 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col24a1Q30D77 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col24a1Q30D77 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Col24a1Q30D77 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Col24a1Q30D77 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Col24a1Q30D77 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Col24a1Q30D77 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Col24a1Q30D77 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col24a1Q30D77 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Col24a1Q30D77 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Col24a1Q30D77 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col24a1Q30D77 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col24a1Q30D77 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col24a1Q30D77 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col24a1Q30D77 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Col24a1Q30D77 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col24a1Q30D77 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col24a1Q30D77 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col24a1Q30D77 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col24a1Q30D77 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col24a1Q30D77 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col24a1Q30D77 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Col24a1Q30D77 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col24a1Q30D77 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col24a1Q30D77 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Col24a1Q30D77 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col24a1Q30D77 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Col24a1Q30D77 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Col24a1Q30D77 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col24a1Q30D77 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col24a1Q30D77 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col24a1Q30D77 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col24a1Q30D77 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col24a1Q30D77 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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