Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Shroom4Q1W617 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Shroom4Q1W617 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
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Shroom4Q1W617 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Shroom4Q1W617 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Shroom4Q1W617 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
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Shroom4Q1W617 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Shroom4Q1W617 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Shroom4Q1W617 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
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Shroom4Q1W617 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Shroom4Q1W617 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
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