Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Samd11Q1RNF8 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Samd11Q1RNF8 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Samd11Q1RNF8 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Samd11Q1RNF8 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Samd11Q1RNF8 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Samd11Q1RNF8 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Samd11Q1RNF8 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Samd11Q1RNF8 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Samd11Q1RNF8 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Samd11Q1RNF8 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Samd11Q1RNF8 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Samd11Q1RNF8 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Samd11Q1RNF8 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Samd11Q1RNF8 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Samd11Q1RNF8 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Samd11Q1RNF8 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Samd11Q1RNF8 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Samd11Q1RNF8 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Samd11Q1RNF8 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Samd11Q1RNF8 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Samd11Q1RNF8 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Samd11Q1RNF8 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Samd11Q1RNF8 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Samd11Q1RNF8 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Samd11Q1RNF8 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Samd11Q1RNF8 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Samd11Q1RNF8 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Samd11Q1RNF8 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Samd11Q1RNF8 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Samd11Q1RNF8 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Samd11Q1RNF8 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Samd11Q1RNF8 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Samd11Q1RNF8 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Samd11Q1RNF8 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Samd11Q1RNF8 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Samd11Q1RNF8 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Samd11Q1RNF8 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Samd11Q1RNF8 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Samd11Q1RNF8 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Samd11Q1RNF8 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Samd11Q1RNF8 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Samd11Q1RNF8 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Samd11Q1RNF8 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Samd11Q1RNF8 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Samd11Q1RNF8 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Samd11Q1RNF8 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Samd11Q1RNF8 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Samd11Q1RNF8 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Samd11Q1RNF8 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Samd11Q1RNF8 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Samd11Q1RNF8 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Samd11Q1RNF8 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Samd11Q1RNF8 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Samd11Q1RNF8 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Samd11Q1RNF8 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Samd11Q1RNF8 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Samd11Q1RNF8 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Samd11Q1RNF8 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Samd11Q1RNF8 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Samd11Q1RNF8 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Samd11Q1RNF8 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Samd11Q1RNF8 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Samd11Q1RNF8 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Samd11Q1RNF8 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Samd11Q1RNF8 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Samd11Q1RNF8 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Samd11Q1RNF8 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Samd11Q1RNF8 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Samd11Q1RNF8 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Samd11Q1RNF8 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Samd11Q1RNF8 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Samd11Q1RNF8 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Samd11Q1RNF8 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Samd11Q1RNF8 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Samd11Q1RNF8 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Samd11Q1RNF8 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Samd11Q1RNF8 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Samd11Q1RNF8 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Samd11Q1RNF8 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Samd11Q1RNF8 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Samd11Q1RNF8 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Samd11Q1RNF8 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Samd11Q1RNF8 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Samd11Q1RNF8 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Samd11Q1RNF8 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Samd11Q1RNF8 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Samd11Q1RNF8 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Samd11Q1RNF8 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Samd11Q1RNF8 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Samd11Q1RNF8 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Samd11Q1RNF8 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Samd11Q1RNF8 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Samd11Q1RNF8 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Samd11Q1RNF8 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Samd11Q1RNF8 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Samd11Q1RNF8 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Samd11Q1RNF8 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Samd11Q1RNF8 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Samd11Q1RNF8 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
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