Protein–RNA interactions for Protein: Q14C51

Ptcd3, Pentatricopeptide repeat domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptcd3Q14C51 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ptcd3Q14C51 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms