Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC13□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC13□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC13□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC13□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC13□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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ptchd1Q14B62 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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ptchd1Q14B62 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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ptchd1Q14B62 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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ptchd1Q14B62 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms