Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Rpusd2Q149F1 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpusd2Q149F1 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Rpusd2Q149F1 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpusd2Q149F1 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Rpusd2Q149F1 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Rpusd2Q149F1 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Rpusd2Q149F1 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpusd2Q149F1 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpusd2Q149F1 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpusd2Q149F1 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpusd2Q149F1 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpusd2Q149F1 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpusd2Q149F1 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Rpusd2Q149F1 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpusd2Q149F1 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Rpusd2Q149F1 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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