Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp2b3Q0VF55 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.8 ms