Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Gm42779-201ENSMUST00000198807 406 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TrioQ0KL02 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms