Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNG1Q06432 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms