Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 9230113P08Rik-201ENSMUST00000176049 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Arl6-203ENSMUST00000118438 875 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Gm16147-201ENSMUST00000162143 373 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Phf11b-201ENSMUST00000166121 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Gm28917-201ENSMUST00000187294 237 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Gm17611-202ENSMUST00000220613 814 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Gm11652-201ENSMUST00000117842 1267 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 4930448D08Rik-201ENSMUST00000149958 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Gm42942-201ENSMUST00000196086 1328 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Gm43149-201ENSMUST00000198162 1422 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Sox12Q04890 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Aknaos-201ENSMUST00000144095 1104 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Gm3573-201ENSMUST00000168673 898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Gm3486-201ENSMUST00000169361 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Gm4181-201ENSMUST00000170249 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Olfr1310-201ENSMUST00000207169 1009 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms