Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scg2Q03517 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms