Protein–RNA interactions for Protein: Q03366

Ccl7, C-C motif chemokine 7, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl7Q03366 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl7Q03366 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl7Q03366 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl7Q03366 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl7Q03366 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl7Q03366 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl7Q03366 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl7Q03366 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl7Q03366 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl7Q03366 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl7Q03366 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccl7Q03366 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.4 ms