Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snai1Q02085 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms