Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms