Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Grin2bQ01097 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms