Protein–RNA interactions for Protein: Q00175

Pgr, Progesterone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PgrQ00175 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PgrQ00175 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PgrQ00175 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PgrQ00175 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PgrQ00175 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PgrQ00175 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PgrQ00175 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PgrQ00175 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PgrQ00175 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PgrQ00175 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PgrQ00175 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PgrQ00175 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PgrQ00175 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PgrQ00175 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PgrQ00175 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PgrQ00175 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PgrQ00175 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PgrQ00175 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PgrQ00175 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PgrQ00175 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PgrQ00175 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PgrQ00175 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PgrQ00175 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PgrQ00175 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PgrQ00175 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PgrQ00175 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PgrQ00175 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PgrQ00175 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PgrQ00175 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PgrQ00175 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PgrQ00175 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PgrQ00175 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PgrQ00175 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PgrQ00175 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PgrQ00175 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
PgrQ00175 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
PgrQ00175 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
PgrQ00175 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PgrQ00175 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PgrQ00175 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PgrQ00175 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PgrQ00175 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PgrQ00175 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PgrQ00175 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PgrQ00175 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PgrQ00175 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PgrQ00175 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PgrQ00175 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PgrQ00175 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PgrQ00175 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PgrQ00175 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PgrQ00175 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PgrQ00175 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PgrQ00175 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PgrQ00175 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PgrQ00175 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PgrQ00175 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PgrQ00175 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PgrQ00175 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PgrQ00175 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PgrQ00175 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PgrQ00175 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PgrQ00175 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PgrQ00175 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PgrQ00175 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PgrQ00175 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PgrQ00175 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PgrQ00175 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PgrQ00175 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PgrQ00175 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PgrQ00175 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PgrQ00175 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PgrQ00175 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PgrQ00175 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PgrQ00175 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PgrQ00175 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PgrQ00175 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PgrQ00175 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PgrQ00175 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PgrQ00175 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PgrQ00175 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PgrQ00175 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PgrQ00175 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PgrQ00175 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PgrQ00175 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PgrQ00175 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PgrQ00175 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PgrQ00175 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PgrQ00175 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PgrQ00175 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PgrQ00175 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PgrQ00175 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PgrQ00175 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PgrQ00175 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PgrQ00175 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PgrQ00175 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PgrQ00175 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PgrQ00175 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PgrQ00175 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PgrQ00175 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms