Protein–RNA interactions for Protein: P97785

Gfra1, GDNF family receptor alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra1P97785 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gfra1P97785 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gfra1P97785 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gfra1P97785 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gfra1P97785 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gfra1P97785 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gfra1P97785 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gfra1P97785 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gfra1P97785 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gfra1P97785 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gfra1P97785 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gfra1P97785 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gfra1P97785 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gfra1P97785 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gfra1P97785 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gfra1P97785 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gfra1P97785 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gfra1P97785 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gfra1P97785 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gfra1P97785 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gfra1P97785 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gfra1P97785 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gfra1P97785 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gfra1P97785 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gfra1P97785 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gfra1P97785 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gfra1P97785 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gfra1P97785 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gfra1P97785 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gfra1P97785 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gfra1P97785 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gfra1P97785 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gfra1P97785 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gfra1P97785 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gfra1P97785 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gfra1P97785 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gfra1P97785 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gfra1P97785 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gfra1P97785 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gfra1P97785 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gfra1P97785 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gfra1P97785 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gfra1P97785 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gfra1P97785 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gfra1P97785 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gfra1P97785 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gfra1P97785 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gfra1P97785 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gfra1P97785 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gfra1P97785 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gfra1P97785 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gfra1P97785 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gfra1P97785 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gfra1P97785 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gfra1P97785 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gfra1P97785 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gfra1P97785 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gfra1P97785 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gfra1P97785 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gfra1P97785 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gfra1P97785 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gfra1P97785 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gfra1P97785 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gfra1P97785 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gfra1P97785 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gfra1P97785 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gfra1P97785 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gfra1P97785 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gfra1P97785 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gfra1P97785 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gfra1P97785 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gfra1P97785 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gfra1P97785 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gfra1P97785 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gfra1P97785 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gfra1P97785 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gfra1P97785 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gfra1P97785 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gfra1P97785 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gfra1P97785 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gfra1P97785 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gfra1P97785 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gfra1P97785 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gfra1P97785 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gfra1P97785 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gfra1P97785 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gfra1P97785 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gfra1P97785 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gfra1P97785 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gfra1P97785 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gfra1P97785 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gfra1P97785 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gfra1P97785 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gfra1P97785 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gfra1P97785 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gfra1P97785 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gfra1P97785 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gfra1P97785 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gfra1P97785 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gfra1P97785 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms