Protein–RNA interactions for Protein: P97348

Rhod, Rho-related GTP-binding protein RhoD, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhodP97348 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RhodP97348 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RhodP97348 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RhodP97348 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
RhodP97348 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
RhodP97348 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RhodP97348 4933405E24Rik-201ENSMUST00000131019 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RhodP97348 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RhodP97348 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RhodP97348 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RhodP97348 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
RhodP97348 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
RhodP97348 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RhodP97348 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
RhodP97348 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RhodP97348 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
RhodP97348 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RhodP97348 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RhodP97348 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RhodP97348 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RhodP97348 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RhodP97348 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RhodP97348 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RhodP97348 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RhodP97348 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RhodP97348 Gm38116-201ENSMUST00000193873 1533 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
RhodP97348 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RhodP97348 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RhodP97348 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RhodP97348 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RhodP97348 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RhodP97348 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RhodP97348 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RhodP97348 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RhodP97348 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RhodP97348 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RhodP97348 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RhodP97348 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RhodP97348 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RhodP97348 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RhodP97348 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RhodP97348 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RhodP97348 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RhodP97348 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RhodP97348 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RhodP97348 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
RhodP97348 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RhodP97348 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RhodP97348 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RhodP97348 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RhodP97348 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RhodP97348 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RhodP97348 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RhodP97348 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RhodP97348 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RhodP97348 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
RhodP97348 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RhodP97348 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RhodP97348 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
RhodP97348 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RhodP97348 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RhodP97348 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RhodP97348 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RhodP97348 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RhodP97348 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RhodP97348 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RhodP97348 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RhodP97348 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RhodP97348 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
RhodP97348 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RhodP97348 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RhodP97348 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RhodP97348 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RhodP97348 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RhodP97348 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RhodP97348 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RhodP97348 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RhodP97348 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RhodP97348 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RhodP97348 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RhodP97348 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RhodP97348 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RhodP97348 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RhodP97348 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RhodP97348 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RhodP97348 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
RhodP97348 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RhodP97348 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RhodP97348 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RhodP97348 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RhodP97348 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RhodP97348 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
RhodP97348 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RhodP97348 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
RhodP97348 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
RhodP97348 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RhodP97348 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RhodP97348 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RhodP97348 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RhodP97348 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms