Protein–RNA interactions for Protein: P82198

Tgfbi, Transforming growth factor-beta-induced protein ig-h3, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfbiP82198 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TgfbiP82198 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms