Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gabpb2P81069 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gabpb2P81069 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gabpb2P81069 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gabpb2P81069 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gabpb2P81069 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gabpb2P81069 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gabpb2P81069 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gabpb2P81069 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gabpb2P81069 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gabpb2P81069 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gabpb2P81069 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gabpb2P81069 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gabpb2P81069 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gabpb2P81069 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gabpb2P81069 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gabpb2P81069 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gabpb2P81069 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gabpb2P81069 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gabpb2P81069 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gabpb2P81069 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gabpb2P81069 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gabpb2P81069 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gabpb2P81069 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gabpb2P81069 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gabpb2P81069 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gabpb2P81069 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gabpb2P81069 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gabpb2P81069 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gabpb2P81069 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gabpb2P81069 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gabpb2P81069 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gabpb2P81069 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gabpb2P81069 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gabpb2P81069 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gabpb2P81069 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gabpb2P81069 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gabpb2P81069 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gabpb2P81069 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gabpb2P81069 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gabpb2P81069 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gabpb2P81069 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gabpb2P81069 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gabpb2P81069 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gabpb2P81069 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gabpb2P81069 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gabpb2P81069 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gabpb2P81069 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gabpb2P81069 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gabpb2P81069 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gabpb2P81069 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gabpb2P81069 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gabpb2P81069 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gabpb2P81069 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gabpb2P81069 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabpb2P81069 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabpb2P81069 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabpb2P81069 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabpb2P81069 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabpb2P81069 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabpb2P81069 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabpb2P81069 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabpb2P81069 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gabpb2P81069 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabpb2P81069 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gabpb2P81069 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabpb2P81069 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gabpb2P81069 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabpb2P81069 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabpb2P81069 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabpb2P81069 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gabpb2P81069 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gabpb2P81069 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gabpb2P81069 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gabpb2P81069 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabpb2P81069 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Gabpb2P81069 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabpb2P81069 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gabpb2P81069 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabpb2P81069 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabpb2P81069 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabpb2P81069 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabpb2P81069 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gabpb2P81069 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabpb2P81069 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabpb2P81069 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gabpb2P81069 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabpb2P81069 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gabpb2P81069 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabpb2P81069 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabpb2P81069 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gabpb2P81069 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gabpb2P81069 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gabpb2P81069 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gabpb2P81069 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gabpb2P81069 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gabpb2P81069 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Gabpb2P81069 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gabpb2P81069 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Gabpb2P81069 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms