Protein–RNA interactions for Protein: P70662

Ldb1, LIM domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb1P70662 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ldb1P70662 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ldb1P70662 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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