Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.63
Usp9xP70398 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms