Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Traf5P70191 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Traf5P70191 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Traf5P70191 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Traf5P70191 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Traf5P70191 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Traf5P70191 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Traf5P70191 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Traf5P70191 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Traf5P70191 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Traf5P70191 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Traf5P70191 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Traf5P70191 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Traf5P70191 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Traf5P70191 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Traf5P70191 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf5P70191 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf5P70191 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf5P70191 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf5P70191 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf5P70191 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf5P70191 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf5P70191 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf5P70191 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf5P70191 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf5P70191 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf5P70191 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf5P70191 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf5P70191 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf5P70191 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf5P70191 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf5P70191 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf5P70191 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf5P70191 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf5P70191 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf5P70191 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf5P70191 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf5P70191 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf5P70191 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf5P70191 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf5P70191 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf5P70191 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf5P70191 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf5P70191 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf5P70191 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf5P70191 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf5P70191 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf5P70191 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf5P70191 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf5P70191 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf5P70191 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf5P70191 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf5P70191 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf5P70191 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf5P70191 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf5P70191 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf5P70191 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf5P70191 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf5P70191 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf5P70191 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf5P70191 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf5P70191 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf5P70191 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf5P70191 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf5P70191 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf5P70191 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf5P70191 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf5P70191 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf5P70191 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf5P70191 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf5P70191 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf5P70191 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf5P70191 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf5P70191 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf5P70191 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf5P70191 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf5P70191 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf5P70191 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf5P70191 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf5P70191 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf5P70191 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf5P70191 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf5P70191 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf5P70191 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf5P70191 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf5P70191 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf5P70191 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf5P70191 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf5P70191 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf5P70191 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf5P70191 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf5P70191 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf5P70191 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf5P70191 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf5P70191 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf5P70191 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf5P70191 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf5P70191 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf5P70191 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf5P70191 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms