Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SbdsP70122 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SbdsP70122 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SbdsP70122 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SbdsP70122 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SbdsP70122 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SbdsP70122 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SbdsP70122 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SbdsP70122 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SbdsP70122 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SbdsP70122 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SbdsP70122 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
SbdsP70122 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SbdsP70122 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SbdsP70122 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SbdsP70122 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SbdsP70122 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SbdsP70122 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SbdsP70122 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SbdsP70122 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SbdsP70122 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SbdsP70122 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SbdsP70122 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SbdsP70122 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SbdsP70122 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SbdsP70122 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SbdsP70122 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SbdsP70122 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SbdsP70122 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SbdsP70122 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SbdsP70122 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SbdsP70122 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SbdsP70122 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SbdsP70122 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SbdsP70122 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SbdsP70122 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SbdsP70122 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SbdsP70122 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SbdsP70122 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SbdsP70122 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SbdsP70122 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SbdsP70122 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SbdsP70122 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SbdsP70122 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SbdsP70122 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SbdsP70122 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SbdsP70122 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SbdsP70122 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SbdsP70122 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SbdsP70122 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SbdsP70122 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SbdsP70122 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SbdsP70122 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SbdsP70122 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SbdsP70122 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SbdsP70122 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SbdsP70122 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SbdsP70122 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
SbdsP70122 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
SbdsP70122 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SbdsP70122 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SbdsP70122 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
SbdsP70122 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SbdsP70122 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SbdsP70122 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SbdsP70122 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
SbdsP70122 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SbdsP70122 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SbdsP70122 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SbdsP70122 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SbdsP70122 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SbdsP70122 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SbdsP70122 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SbdsP70122 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SbdsP70122 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SbdsP70122 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SbdsP70122 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SbdsP70122 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SbdsP70122 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SbdsP70122 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
SbdsP70122 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SbdsP70122 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SbdsP70122 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SbdsP70122 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SbdsP70122 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SbdsP70122 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SbdsP70122 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SbdsP70122 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SbdsP70122 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SbdsP70122 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SbdsP70122 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SbdsP70122 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SbdsP70122 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SbdsP70122 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SbdsP70122 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SbdsP70122 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SbdsP70122 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SbdsP70122 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SbdsP70122 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SbdsP70122 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms