Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rps3P62908 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rps3P62908 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rps3P62908 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rps3P62908 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rps3P62908 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rps3P62908 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rps3P62908 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.7 ms