Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppfia3P60469 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms