Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nphp4P59240 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nphp4P59240 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nphp4P59240 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nphp4P59240 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nphp4P59240 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nphp4P59240 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Nphp4P59240 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nphp4P59240 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nphp4P59240 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nphp4P59240 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nphp4P59240 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nphp4P59240 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nphp4P59240 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nphp4P59240 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nphp4P59240 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nphp4P59240 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nphp4P59240 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nphp4P59240 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nphp4P59240 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Nphp4P59240 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nphp4P59240 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nphp4P59240 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nphp4P59240 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Nphp4P59240 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Nphp4P59240 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nphp4P59240 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Nphp4P59240 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nphp4P59240 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nphp4P59240 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nphp4P59240 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nphp4P59240 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nphp4P59240 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nphp4P59240 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nphp4P59240 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nphp4P59240 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nphp4P59240 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nphp4P59240 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nphp4P59240 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nphp4P59240 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nphp4P59240 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nphp4P59240 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nphp4P59240 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nphp4P59240 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Nphp4P59240 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nphp4P59240 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nphp4P59240 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nphp4P59240 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nphp4P59240 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nphp4P59240 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nphp4P59240 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nphp4P59240 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nphp4P59240 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nphp4P59240 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nphp4P59240 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nphp4P59240 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nphp4P59240 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nphp4P59240 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nphp4P59240 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nphp4P59240 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nphp4P59240 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nphp4P59240 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nphp4P59240 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nphp4P59240 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nphp4P59240 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nphp4P59240 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nphp4P59240 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nphp4P59240 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nphp4P59240 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nphp4P59240 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nphp4P59240 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Nphp4P59240 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Nphp4P59240 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nphp4P59240 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Nphp4P59240 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nphp4P59240 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nphp4P59240 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nphp4P59240 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nphp4P59240 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nphp4P59240 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nphp4P59240 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nphp4P59240 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nphp4P59240 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nphp4P59240 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nphp4P59240 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nphp4P59240 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nphp4P59240 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nphp4P59240 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Nphp4P59240 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nphp4P59240 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nphp4P59240 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nphp4P59240 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nphp4P59240 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nphp4P59240 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nphp4P59240 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nphp4P59240 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nphp4P59240 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Nphp4P59240 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Nphp4P59240 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Nphp4P59240 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms