Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Cldn18P56857 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Cldn18P56857 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Cldn18P56857 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Cldn18P56857 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Cldn18P56857 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Cldn18P56857 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Cldn18P56857 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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