Protein–RNA interactions for Protein: P56213

Gfer, FAD-linked sulfhydryl oxidase ALR, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GferP56213 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
GferP56213 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
GferP56213 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
GferP56213 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
GferP56213 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GferP56213 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GferP56213 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GferP56213 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GferP56213 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GferP56213 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GferP56213 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
GferP56213 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GferP56213 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GferP56213 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GferP56213 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GferP56213 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GferP56213 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GferP56213 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
GferP56213 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GferP56213 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
GferP56213 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
GferP56213 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
GferP56213 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
GferP56213 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
GferP56213 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
GferP56213 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
GferP56213 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GferP56213 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
GferP56213 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
GferP56213 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
GferP56213 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
GferP56213 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GferP56213 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GferP56213 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GferP56213 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
GferP56213 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GferP56213 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GferP56213 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GferP56213 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GferP56213 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GferP56213 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
GferP56213 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GferP56213 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
GferP56213 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GferP56213 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
GferP56213 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
GferP56213 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GferP56213 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GferP56213 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GferP56213 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GferP56213 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GferP56213 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
GferP56213 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GferP56213 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GferP56213 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GferP56213 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GferP56213 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
GferP56213 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
GferP56213 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
GferP56213 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GferP56213 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GferP56213 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GferP56213 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GferP56213 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GferP56213 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GferP56213 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
GferP56213 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
GferP56213 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GferP56213 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
GferP56213 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
GferP56213 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
GferP56213 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
GferP56213 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
GferP56213 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
GferP56213 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GferP56213 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GferP56213 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
GferP56213 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GferP56213 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
GferP56213 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GferP56213 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GferP56213 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GferP56213 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GferP56213 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GferP56213 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GferP56213 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GferP56213 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GferP56213 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GferP56213 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GferP56213 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GferP56213 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GferP56213 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GferP56213 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GferP56213 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GferP56213 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
GferP56213 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GferP56213 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
GferP56213 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
GferP56213 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
GferP56213 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms