Protein–RNA interactions for Protein: P53996

Cnbp, Cellular nucleic acid-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CnbpP53996 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
CnbpP53996 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
CnbpP53996 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
CnbpP53996 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
CnbpP53996 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
CnbpP53996 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
CnbpP53996 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
CnbpP53996 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
CnbpP53996 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
CnbpP53996 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
CnbpP53996 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
CnbpP53996 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
CnbpP53996 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
CnbpP53996 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
CnbpP53996 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
CnbpP53996 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
CnbpP53996 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
CnbpP53996 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
CnbpP53996 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
CnbpP53996 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
CnbpP53996 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
CnbpP53996 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
CnbpP53996 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
CnbpP53996 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
CnbpP53996 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
CnbpP53996 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
CnbpP53996 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
CnbpP53996 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
CnbpP53996 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
CnbpP53996 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
CnbpP53996 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
CnbpP53996 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
CnbpP53996 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
CnbpP53996 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
CnbpP53996 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
CnbpP53996 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC9□□□□□ -0.97
CnbpP53996 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
CnbpP53996 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
CnbpP53996 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
CnbpP53996 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
CnbpP53996 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
CnbpP53996 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
CnbpP53996 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
CnbpP53996 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
CnbpP53996 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
CnbpP53996 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
CnbpP53996 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
CnbpP53996 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
CnbpP53996 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
CnbpP53996 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
CnbpP53996 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC9□□□□□ -0.97
CnbpP53996 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
CnbpP53996 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
CnbpP53996 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
CnbpP53996 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
CnbpP53996 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
CnbpP53996 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
CnbpP53996 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
CnbpP53996 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
CnbpP53996 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
CnbpP53996 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
CnbpP53996 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
CnbpP53996 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
CnbpP53996 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
CnbpP53996 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC8.99□□□□□ -0.97
CnbpP53996 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
CnbpP53996 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
CnbpP53996 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
CnbpP53996 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
CnbpP53996 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
CnbpP53996 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
CnbpP53996 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
CnbpP53996 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
CnbpP53996 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
CnbpP53996 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
CnbpP53996 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
CnbpP53996 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC8.99□□□□□ -0.97
CnbpP53996 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC8.99□□□□□ -0.97
CnbpP53996 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
CnbpP53996 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
CnbpP53996 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
CnbpP53996 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
CnbpP53996 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
CnbpP53996 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
CnbpP53996 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
CnbpP53996 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC8.99□□□□□ -0.97
CnbpP53996 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
CnbpP53996 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
CnbpP53996 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
CnbpP53996 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
CnbpP53996 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
CnbpP53996 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
CnbpP53996 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
CnbpP53996 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
CnbpP53996 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
CnbpP53996 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
CnbpP53996 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
CnbpP53996 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
CnbpP53996 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
CnbpP53996 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
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