Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LtbrP50284 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Gm6358-202ENSMUST00000187643 489 ntAPPRIS P5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LtbrP50284 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Gm22885-201ENSMUST00000157410 107 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Olfr1460-ps1-201ENSMUST00000208975 899 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LtbrP50284 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LtbrP50284 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LtbrP50284 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms