Protein–RNA interactions for Protein: P48030

Tgfa, Protransforming growth factor alpha, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfaP48030 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TgfaP48030 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TgfaP48030 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
TgfaP48030 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TgfaP48030 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TgfaP48030 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TgfaP48030 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TgfaP48030 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TgfaP48030 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TgfaP48030 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TgfaP48030 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TgfaP48030 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
TgfaP48030 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TgfaP48030 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TgfaP48030 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TgfaP48030 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TgfaP48030 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TgfaP48030 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TgfaP48030 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TgfaP48030 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TgfaP48030 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
TgfaP48030 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TgfaP48030 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
TgfaP48030 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TgfaP48030 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
TgfaP48030 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
TgfaP48030 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
TgfaP48030 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TgfaP48030 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TgfaP48030 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TgfaP48030 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TgfaP48030 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TgfaP48030 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TgfaP48030 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TgfaP48030 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TgfaP48030 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TgfaP48030 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TgfaP48030 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TgfaP48030 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TgfaP48030 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TgfaP48030 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TgfaP48030 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TgfaP48030 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TgfaP48030 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TgfaP48030 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TgfaP48030 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TgfaP48030 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TgfaP48030 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TgfaP48030 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
TgfaP48030 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.55
TgfaP48030 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
TgfaP48030 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
TgfaP48030 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
TgfaP48030 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
TgfaP48030 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
TgfaP48030 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
TgfaP48030 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TgfaP48030 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TgfaP48030 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TgfaP48030 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TgfaP48030 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TgfaP48030 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TgfaP48030 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TgfaP48030 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TgfaP48030 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TgfaP48030 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TgfaP48030 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TgfaP48030 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TgfaP48030 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TgfaP48030 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TgfaP48030 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TgfaP48030 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TgfaP48030 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TgfaP48030 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TgfaP48030 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TgfaP48030 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TgfaP48030 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TgfaP48030 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TgfaP48030 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TgfaP48030 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TgfaP48030 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TgfaP48030 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TgfaP48030 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TgfaP48030 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TgfaP48030 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TgfaP48030 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TgfaP48030 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TgfaP48030 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TgfaP48030 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TgfaP48030 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TgfaP48030 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TgfaP48030 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TgfaP48030 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TgfaP48030 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TgfaP48030 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TgfaP48030 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TgfaP48030 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TgfaP48030 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TgfaP48030 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TgfaP48030 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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