Protein–RNA interactions for Protein: P46735

Myo1b, Unconventional myosin-Ib, mousemouse

Predictions only

Length 1,107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo1bP46735 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms