Protein–RNA interactions for Protein: P43027

Gdf5, Growth/differentiation factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf5P43027 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gdf5P43027 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms