Protein–RNA interactions for Protein: P41778

Pbx1, Pre-B-cell leukemia transcription factor 1, mousemouse

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Length 430 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbx1P41778 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pbx1P41778 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pbx1P41778 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pbx1P41778 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pbx1P41778 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pbx1P41778 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pbx1P41778 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pbx1P41778 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pbx1P41778 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pbx1P41778 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pbx1P41778 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pbx1P41778 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pbx1P41778 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pbx1P41778 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pbx1P41778 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pbx1P41778 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pbx1P41778 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pbx1P41778 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pbx1P41778 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pbx1P41778 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pbx1P41778 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pbx1P41778 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pbx1P41778 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pbx1P41778 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pbx1P41778 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pbx1P41778 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pbx1P41778 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pbx1P41778 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pbx1P41778 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pbx1P41778 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pbx1P41778 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pbx1P41778 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pbx1P41778 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pbx1P41778 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pbx1P41778 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pbx1P41778 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pbx1P41778 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pbx1P41778 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pbx1P41778 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pbx1P41778 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pbx1P41778 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pbx1P41778 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pbx1P41778 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pbx1P41778 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pbx1P41778 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pbx1P41778 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pbx1P41778 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pbx1P41778 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pbx1P41778 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pbx1P41778 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pbx1P41778 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pbx1P41778 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pbx1P41778 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pbx1P41778 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pbx1P41778 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pbx1P41778 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pbx1P41778 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pbx1P41778 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pbx1P41778 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pbx1P41778 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pbx1P41778 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pbx1P41778 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pbx1P41778 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Pbx1P41778 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pbx1P41778 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pbx1P41778 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pbx1P41778 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pbx1P41778 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pbx1P41778 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pbx1P41778 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pbx1P41778 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Pbx1P41778 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pbx1P41778 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pbx1P41778 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pbx1P41778 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pbx1P41778 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pbx1P41778 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pbx1P41778 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pbx1P41778 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pbx1P41778 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Pbx1P41778 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pbx1P41778 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pbx1P41778 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pbx1P41778 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Pbx1P41778 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pbx1P41778 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pbx1P41778 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pbx1P41778 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pbx1P41778 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pbx1P41778 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pbx1P41778 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pbx1P41778 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pbx1P41778 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pbx1P41778 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Pbx1P41778 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pbx1P41778 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pbx1P41778 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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