Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Tnfsf9P41274 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Tnfsf9P41274 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Tnfsf9P41274 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Tnfsf9P41274 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Tnfsf9P41274 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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