Protein–RNA interactions for Protein: P35396

Ppard, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpardP35396 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PpardP35396 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PpardP35396 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PpardP35396 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PpardP35396 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PpardP35396 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PpardP35396 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PpardP35396 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PpardP35396 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PpardP35396 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PpardP35396 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PpardP35396 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PpardP35396 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PpardP35396 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PpardP35396 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PpardP35396 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PpardP35396 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PpardP35396 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PpardP35396 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PpardP35396 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PpardP35396 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PpardP35396 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PpardP35396 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PpardP35396 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PpardP35396 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PpardP35396 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PpardP35396 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PpardP35396 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PpardP35396 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PpardP35396 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PpardP35396 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PpardP35396 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PpardP35396 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PpardP35396 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PpardP35396 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PpardP35396 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PpardP35396 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PpardP35396 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PpardP35396 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PpardP35396 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PpardP35396 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PpardP35396 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PpardP35396 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PpardP35396 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PpardP35396 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PpardP35396 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PpardP35396 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PpardP35396 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PpardP35396 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PpardP35396 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PpardP35396 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PpardP35396 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PpardP35396 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PpardP35396 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PpardP35396 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PpardP35396 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PpardP35396 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PpardP35396 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PpardP35396 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PpardP35396 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PpardP35396 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PpardP35396 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PpardP35396 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PpardP35396 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PpardP35396 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PpardP35396 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PpardP35396 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PpardP35396 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PpardP35396 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PpardP35396 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PpardP35396 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PpardP35396 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PpardP35396 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PpardP35396 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PpardP35396 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PpardP35396 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PpardP35396 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PpardP35396 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PpardP35396 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PpardP35396 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PpardP35396 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PpardP35396 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PpardP35396 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PpardP35396 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PpardP35396 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PpardP35396 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PpardP35396 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PpardP35396 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PpardP35396 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PpardP35396 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PpardP35396 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PpardP35396 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PpardP35396 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PpardP35396 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PpardP35396 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PpardP35396 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PpardP35396 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PpardP35396 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PpardP35396 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PpardP35396 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms