Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nedd1P33215 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Nedd1P33215 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nedd1P33215 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nedd1P33215 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nedd1P33215 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nedd1P33215 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nedd1P33215 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Nedd1P33215 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Nedd1P33215 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nedd1P33215 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nedd1P33215 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nedd1P33215 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nedd1P33215 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nedd1P33215 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nedd1P33215 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nedd1P33215 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nedd1P33215 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nedd1P33215 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nedd1P33215 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nedd1P33215 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nedd1P33215 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nedd1P33215 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nedd1P33215 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nedd1P33215 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nedd1P33215 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nedd1P33215 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nedd1P33215 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nedd1P33215 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Nedd1P33215 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nedd1P33215 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nedd1P33215 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nedd1P33215 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nedd1P33215 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nedd1P33215 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nedd1P33215 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nedd1P33215 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nedd1P33215 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nedd1P33215 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nedd1P33215 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nedd1P33215 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nedd1P33215 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nedd1P33215 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nedd1P33215 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nedd1P33215 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nedd1P33215 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nedd1P33215 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nedd1P33215 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nedd1P33215 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nedd1P33215 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nedd1P33215 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Nedd1P33215 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nedd1P33215 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nedd1P33215 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nedd1P33215 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nedd1P33215 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Nedd1P33215 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nedd1P33215 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nedd1P33215 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nedd1P33215 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nedd1P33215 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nedd1P33215 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Nedd1P33215 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Nedd1P33215 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nedd1P33215 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nedd1P33215 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nedd1P33215 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nedd1P33215 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nedd1P33215 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Nedd1P33215 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nedd1P33215 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Nedd1P33215 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
Nedd1P33215 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Nedd1P33215 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nedd1P33215 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Nedd1P33215 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Nedd1P33215 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Nedd1P33215 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nedd1P33215 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Nedd1P33215 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Nedd1P33215 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Nedd1P33215 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Nedd1P33215 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Nedd1P33215 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nedd1P33215 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Nedd1P33215 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nedd1P33215 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nedd1P33215 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nedd1P33215 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nedd1P33215 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nedd1P33215 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nedd1P33215 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nedd1P33215 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nedd1P33215 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nedd1P33215 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nedd1P33215 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nedd1P33215 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nedd1P33215 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nedd1P33215 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nedd1P33215 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms