Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
VtnP29788 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
VtnP29788 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
VtnP29788 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
VtnP29788 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
VtnP29788 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
VtnP29788 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
VtnP29788 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
VtnP29788 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
VtnP29788 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
VtnP29788 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
VtnP29788 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
VtnP29788 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
VtnP29788 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
VtnP29788 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
VtnP29788 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
VtnP29788 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
VtnP29788 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
VtnP29788 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
VtnP29788 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
VtnP29788 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
VtnP29788 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
VtnP29788 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
VtnP29788 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
VtnP29788 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
VtnP29788 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
VtnP29788 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
VtnP29788 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
VtnP29788 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
VtnP29788 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
VtnP29788 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
VtnP29788 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
VtnP29788 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
VtnP29788 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
VtnP29788 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
VtnP29788 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
VtnP29788 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
VtnP29788 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
VtnP29788 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
VtnP29788 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
VtnP29788 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
VtnP29788 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
VtnP29788 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
VtnP29788 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
VtnP29788 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
VtnP29788 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
VtnP29788 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
VtnP29788 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
VtnP29788 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
VtnP29788 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
VtnP29788 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
VtnP29788 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
VtnP29788 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
VtnP29788 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
VtnP29788 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
VtnP29788 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
VtnP29788 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
VtnP29788 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
VtnP29788 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
VtnP29788 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
VtnP29788 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
VtnP29788 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
VtnP29788 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
VtnP29788 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
VtnP29788 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
VtnP29788 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
VtnP29788 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
VtnP29788 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
VtnP29788 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
VtnP29788 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
VtnP29788 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
VtnP29788 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
VtnP29788 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
VtnP29788 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
VtnP29788 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
VtnP29788 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
VtnP29788 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
VtnP29788 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
VtnP29788 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
VtnP29788 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
VtnP29788 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
VtnP29788 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
VtnP29788 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
VtnP29788 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
VtnP29788 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
VtnP29788 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
VtnP29788 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
VtnP29788 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
VtnP29788 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
VtnP29788 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
VtnP29788 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
VtnP29788 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
VtnP29788 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
VtnP29788 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
VtnP29788 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
VtnP29788 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
VtnP29788 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
VtnP29788 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
VtnP29788 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
VtnP29788 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.5 ms