Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RxrgP28705 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RxrgP28705 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RxrgP28705 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
RxrgP28705 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RxrgP28705 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RxrgP28705 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RxrgP28705 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
RxrgP28705 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RxrgP28705 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
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