Protein–RNA interactions for Protein: P28571

Slc6a9, Sodium- and chloride-dependent glycine transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a9P28571 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Slc6a9P28571 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Slc6a9P28571 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Slc6a9P28571 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Slc6a9P28571 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Slc6a9P28571 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Slc6a9P28571 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Slc6a9P28571 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Slc6a9P28571 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Slc6a9P28571 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Slc6a9P28571 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Slc6a9P28571 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Slc6a9P28571 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Slc6a9P28571 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Slc6a9P28571 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Slc6a9P28571 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Slc6a9P28571 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Slc6a9P28571 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Slc6a9P28571 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Slc6a9P28571 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Slc6a9P28571 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Slc6a9P28571 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Slc6a9P28571 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Slc6a9P28571 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Slc6a9P28571 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Slc6a9P28571 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Slc6a9P28571 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Slc6a9P28571 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Slc6a9P28571 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Slc6a9P28571 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Slc6a9P28571 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Slc6a9P28571 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Slc6a9P28571 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Slc6a9P28571 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Slc6a9P28571 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Slc6a9P28571 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Slc6a9P28571 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Slc6a9P28571 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Slc6a9P28571 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Slc6a9P28571 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Slc6a9P28571 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Slc6a9P28571 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Slc6a9P28571 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Slc6a9P28571 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Slc6a9P28571 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Slc6a9P28571 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Slc6a9P28571 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Slc6a9P28571 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Slc6a9P28571 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Slc6a9P28571 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Slc6a9P28571 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Slc6a9P28571 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Slc6a9P28571 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Slc6a9P28571 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Slc6a9P28571 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Slc6a9P28571 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Slc6a9P28571 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Slc6a9P28571 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Slc6a9P28571 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Slc6a9P28571 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Slc6a9P28571 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Slc6a9P28571 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Slc6a9P28571 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Slc6a9P28571 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Slc6a9P28571 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Slc6a9P28571 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Slc6a9P28571 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Slc6a9P28571 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Slc6a9P28571 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Slc6a9P28571 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Slc6a9P28571 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Slc6a9P28571 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Slc6a9P28571 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Slc6a9P28571 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Slc6a9P28571 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Slc6a9P28571 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Slc6a9P28571 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Slc6a9P28571 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Slc6a9P28571 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Slc6a9P28571 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Slc6a9P28571 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Slc6a9P28571 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Slc6a9P28571 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Slc6a9P28571 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Slc6a9P28571 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Slc6a9P28571 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Slc6a9P28571 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Slc6a9P28571 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Slc6a9P28571 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Slc6a9P28571 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Slc6a9P28571 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Slc6a9P28571 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Slc6a9P28571 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Slc6a9P28571 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Slc6a9P28571 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Slc6a9P28571 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Slc6a9P28571 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Slc6a9P28571 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Slc6a9P28571 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Slc6a9P28571 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms