Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxd10P28359 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxd10P28359 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxd10P28359 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxd10P28359 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxd10P28359 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxd10P28359 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Hoxd10P28359 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxd10P28359 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxd10P28359 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Hoxd10P28359 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Hoxd10P28359 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Hoxd10P28359 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxd10P28359 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxd10P28359 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Hoxd10P28359 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxd10P28359 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxd10P28359 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxd10P28359 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxd10P28359 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxd10P28359 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxd10P28359 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxd10P28359 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxd10P28359 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxd10P28359 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxd10P28359 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxd10P28359 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Hoxd10P28359 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Hoxd10P28359 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Hoxd10P28359 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Hoxd10P28359 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Hoxd10P28359 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Hoxd10P28359 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Hoxd10P28359 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Hoxd10P28359 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd10P28359 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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