Protein–RNA interactions for Protein: P23607

Zfa, Zinc finger autosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZfaP23607 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ZfaP23607 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ZfaP23607 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ZfaP23607 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ZfaP23607 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ZfaP23607 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ZfaP23607 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZfaP23607 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZfaP23607 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZfaP23607 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZfaP23607 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZfaP23607 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZfaP23607 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZfaP23607 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZfaP23607 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
ZfaP23607 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZfaP23607 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZfaP23607 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZfaP23607 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZfaP23607 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZfaP23607 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZfaP23607 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZfaP23607 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZfaP23607 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZfaP23607 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZfaP23607 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
ZfaP23607 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZfaP23607 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZfaP23607 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZfaP23607 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZfaP23607 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
ZfaP23607 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZfaP23607 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
ZfaP23607 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
ZfaP23607 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZfaP23607 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZfaP23607 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZfaP23607 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZfaP23607 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZfaP23607 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZfaP23607 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZfaP23607 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZfaP23607 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZfaP23607 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZfaP23607 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZfaP23607 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZfaP23607 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZfaP23607 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZfaP23607 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZfaP23607 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZfaP23607 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZfaP23607 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZfaP23607 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZfaP23607 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZfaP23607 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZfaP23607 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZfaP23607 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZfaP23607 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZfaP23607 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZfaP23607 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZfaP23607 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZfaP23607 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZfaP23607 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
ZfaP23607 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
ZfaP23607 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
ZfaP23607 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZfaP23607 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
ZfaP23607 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
ZfaP23607 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZfaP23607 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZfaP23607 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZfaP23607 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZfaP23607 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZfaP23607 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZfaP23607 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZfaP23607 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZfaP23607 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZfaP23607 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZfaP23607 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZfaP23607 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZfaP23607 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZfaP23607 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZfaP23607 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZfaP23607 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
ZfaP23607 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZfaP23607 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZfaP23607 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZfaP23607 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
ZfaP23607 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZfaP23607 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZfaP23607 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZfaP23607 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZfaP23607 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZfaP23607 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
ZfaP23607 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZfaP23607 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZfaP23607 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZfaP23607 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
ZfaP23607 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZfaP23607 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms