Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PparaP23204 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PparaP23204 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PparaP23204 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PparaP23204 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PparaP23204 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PparaP23204 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PparaP23204 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PparaP23204 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PparaP23204 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PparaP23204 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PparaP23204 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PparaP23204 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PparaP23204 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PparaP23204 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PparaP23204 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PparaP23204 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PparaP23204 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PparaP23204 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PparaP23204 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PparaP23204 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PparaP23204 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PparaP23204 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PparaP23204 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PparaP23204 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PparaP23204 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PparaP23204 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PparaP23204 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PparaP23204 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PparaP23204 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PparaP23204 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PparaP23204 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PparaP23204 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PparaP23204 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PparaP23204 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PparaP23204 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PparaP23204 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PparaP23204 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PparaP23204 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PparaP23204 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PparaP23204 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PparaP23204 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PparaP23204 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PparaP23204 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PparaP23204 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PparaP23204 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PparaP23204 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PparaP23204 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PparaP23204 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PparaP23204 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PparaP23204 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PparaP23204 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PparaP23204 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PparaP23204 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PparaP23204 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PparaP23204 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PparaP23204 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PparaP23204 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PparaP23204 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PparaP23204 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PparaP23204 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PparaP23204 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PparaP23204 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PparaP23204 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PparaP23204 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PparaP23204 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PparaP23204 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PparaP23204 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PparaP23204 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PparaP23204 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PparaP23204 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PparaP23204 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PparaP23204 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PparaP23204 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PparaP23204 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PparaP23204 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PparaP23204 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PparaP23204 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PparaP23204 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PparaP23204 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PparaP23204 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PparaP23204 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PparaP23204 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PparaP23204 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PparaP23204 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PparaP23204 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PparaP23204 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PparaP23204 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PparaP23204 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PparaP23204 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PparaP23204 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PparaP23204 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PparaP23204 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PparaP23204 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PparaP23204 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PparaP23204 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PparaP23204 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PparaP23204 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PparaP23204 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PparaP23204 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms