Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pou5f1P20263 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pou5f1P20263 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms