Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18528 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18528 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18528 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18528 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18528 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18528 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18528 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18528 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18528 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18528 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18528 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18528 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18528 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18528 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
P18528 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18528 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
P18528 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18528 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
P18528 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18528 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18528 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18528 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
P18528 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18528 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18528 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18528 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18528 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18528 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18528 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
P18528 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18528 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18528 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18528 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18528 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18528 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18528 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P18528 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18528 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18528 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18528 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18528 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18528 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18528 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18528 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18528 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18528 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18528 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18528 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18528 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18528 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18528 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18528 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18528 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
P18528 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18528 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
P18528 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
P18528 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
P18528 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18528 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18528 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
P18528 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18528 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18528 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18528 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18528 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18528 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18528 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
P18528 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
P18528 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18528 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18528 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18528 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18528 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18528 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18528 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18528 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P18528 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18528 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18528 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18528 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18528 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18528 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18528 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18528 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18528 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18528 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18528 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18528 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18528 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18528 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18528 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18528 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18528 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18528 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18528 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18528 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18528 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
P18528 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
P18528 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms